RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 DIABLOQ9NR28 239 aa7.65□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 E7ENX8 843 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 HCRTO43612 131 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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