RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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CTDSP2-203ENST00000547701 TO15178 435 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-203ENST00000547701 ACOX3O15254 700 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-203ENST00000547701 GLSO94925 669 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF24P17028 368 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDSP2-203ENST00000547701 DUSP8Q13202 625 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDSP2-203ENST00000547701 TLCD1Q96CP7 247 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-203ENST00000547701 MTERF3Q96E29 417 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-203ENST00000547701 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDSP2-203ENST00000547701 CES4AQ5XG92 561 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP2-203ENST00000547701 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDSP2-203ENST00000547701 TICAM1Q8IUC6 712 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDSP2-203ENST00000547701 GAL3ST4Q96RP7 486 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDSP2-203ENST00000547701 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDSP2-203ENST00000547701 MAPK1P28482 360 aa21.43■■□□□ 1.02
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CTDSP2-203ENST00000547701 RPS6KA2Q15349 733 aa21.43■■□□□ 1.02
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CTDSP2-203ENST00000547701 REEP4Q9H6H4 257 aa21.43■■□□□ 1.02
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CTDSP2-203ENST00000547701 KCNK10P57789 538 aa21.42■■□□□ 1.02
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CTDSP2-203ENST00000547701 LTB4RQ15722 352 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDSP2-203ENST00000547701 CMPK2Q5EBM0 449 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDSP2-203ENST00000547701 C6orf136Q5SQH8 315 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM180BQ6P0A1 224 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDSP2-203ENST00000547701 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC22A16Q86VW1 577 aa21.42■■□□□ 1.02
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