RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533870.1

SOX6-217, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

TSL 5

Gene SOX6, Length 7,224 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-217ENST00000533870 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ADAM2Q99965 735 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ABCB8Q9NUT2 735 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 VEGFDO43915 354 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 F10P00742 488 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 SLC35G6P0C7Q6 338 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 NPR2P20594 1047 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 VIPR1P32241 457 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 BMP8BP34820 402 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 GCGRP47871 477 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PGDP52209 483 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ISXQ2M1V0 245 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PGGHGQ32M88 737 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 SERINC5Q86VE9 423 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ZNF227Q86WZ6 799 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PLPP6Q8IY26 295 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ANKK1Q8NFD2 765 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ASB11Q8WXH4 323 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ING5Q8WYH8 240 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 C17orf62Q9BQA9 187 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 TEX101Q9BY14 249 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 CWH43Q9H720 699 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 TBC1D17Q9HA65 648 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 IFT46Q9NQC8 304 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PRRG1O14668 218 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ARPC3O15145 178 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 CHP2O43745 196 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 TPST2O60704 377 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 LRG1P02750 347 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ZP3P21754 424 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PCMT1P22061 227 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 LMO2P25791 158 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ART1P52961 327 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 NRG3P56975 720 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 BIKQ13323 160 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 OR4D1Q15615 310 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 KLHL26Q53HC5 615 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 C19orf48Q6RUI8 117 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 TMEM205Q6UW68 189 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 RAET1EQ8TD07 263 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 GANCQ8TET4 914 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 P2RY12Q9H244 342 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ACTR10Q9NZ32 417 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 HMSDA8MTL9 139 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PRSS44E7EML9 344 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 TAAR5O14804 337 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 KCNK5O95279 499 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 PMS2P2O95744 297 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 BPNT1O95861 308 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 LAMP1P11279 417 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ZNF3P17036 446 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 MAOBP27338 520 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ADCYAP1R1P41586 468 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 CAP1Q01518 475 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 IKZF1Q13422 519 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 TNK1Q13470 666 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 HES5Q5TA89 166 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 TMEM107Q6UX40 140 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 LINGO2Q7L985 606 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.85□□□□□ -1.79
SOX6-217ENST00000533870 HBEGFQ99075 208 aa3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms