RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAG	P20916	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FCAR	P24071	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP2C18	P33260	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SERPINB8	P50452	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NPTX1	Q15818	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM187A	A6NFU0	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		F8VVB4	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		F8VWA3	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SGK494	L7N484	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LEFTY2	O00292	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SUV39H1	O43463	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LPXN	O60711	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	AMPD1	P23109	780 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	GIF	P27352	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PTGER4	P35408	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RRAD	P55042	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	KLC1	Q07866	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	IL10RB	Q08334	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLK5	Q496M5	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CIB1	Q99828	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MST1R	Q04912	1400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	A2M	P01023	1474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		J3QR06	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	BTN3A3	O00478	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC16A5	O15375	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PFDN1	O60925	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SUPT3H	O75486	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CIAO1	O76071	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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