RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 NANOGP8Q6NSW7 305 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF130Q86XS8 419 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFP90Q8TF47 636 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 NANOGQ9H9S0 305 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 TAS2R1Q9NYW7 299 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 CLIC1O00299 241 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 EMC8O43402 210 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 PLOD3O60568 738 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 SOX11P35716 441 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 BIKQ13323 160 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 C6orf163Q5TEZ5 329 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 OR14A16Q8NHC5 309 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXL20Q96IG2 436 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF12Q96QT6 1004 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10A5Q9H207 317 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 GID8Q9NWU2 228 aa21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 PCSK5Q92824 1860 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC400499M0QZD8 3231 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC14CA4D256 554 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 IGKV3-11P04433 115 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT16P08779 473 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR143P51810 404 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 PSME3P61289 254 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC74AQ0VAA2 488 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 FUT7Q11130 342 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 RUNDC3AQ59EK9 446 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 DEFB107AQ8IZN7 70 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIML2Q8N7C3 387 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF615Q8N8J6 731 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 GIMAP5Q96F15 307 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF700Q9H0M5 742 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 EPS8L2Q9H6S3 715 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 C3orf14Q9HBI5 128 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC6A2P23975 617 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC26A5P58743 744 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 NNATQ16517 81 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 BTBD16Q32M84 506 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF148Q8N7C7 305 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 APCDD1LQ8NCL9 501 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GNT7Q8NFL0 401 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5D16Q8NGK9 328 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf52Q8NHV5 167 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 JADE3Q92613 823 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.14■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 DYRK3O43781 588 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHEP01854 428 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CYC1P08574 325 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNSP34059 522 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 EMDP50402 254 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ST13P50502 369 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MNAT1P51948 309 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC7A2P52569 658 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC37A1P57057 533 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SAXO2Q658L1 398 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1N1Q8NGS0 311 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ROPN1LQ96C74 230 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 IMMP1LQ96LU5 166 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CMTM6Q9NX76 183 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 USP22Q9UPT9 525 aa21.14■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 IGF2RP11717 2491 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A087WV62 115 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MVDP53602 400 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 NCALDP61601 193 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR5P85299 388 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 Q0VFX4 171 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM64Q6YI46 380 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 NDUFAF7Q7L592 441 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 RAXQ9Y2V3 346 aa21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPNS1P04632 268 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 NUDT7P0C024 238 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 ETFAP13804 333 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CORO7P57737 925 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 C9orf40Q8IXQ3 194 aa21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1-208ENST00000524325 MORN4Q8NDC4 146 aa21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms