RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C9orf40Q8IXQ3 194 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALLCQ8N6M5 410 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10G2Q8NGC3 310 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBTD2Q8WUN7 234 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STARD8Q92502 1023 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMARCD2Q92925 531 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEIL2Q969S2 332 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BIRC7Q96CA5 298 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF185Q96GF1 192 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AK8Q96MA6 479 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMD1Q99460 953 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSSK1BQ9BXA7 367 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TPK1Q9H3S4 243 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOL4O94818 638 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WNT2P09544 360 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HNF1AP20823 631 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GLRA1P23415 457 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MPP1Q00013 466 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZIC1Q15915 447 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARSKQ6UWY0 536 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MFSD7Q6UXD7 560 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FRA10AC1Q70Z53 315 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEGR1Q7Z3B1 354 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLFN11Q7Z7L1 901 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERICH1Q86X53 443 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAAF5Q86Y56 855 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TDHQ8IZJ6 230 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NCOA7Q8NI08 942 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C17orf62Q9BQA9 187 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM173AQ9BQD7 235 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF665Q9H7R5 613 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMC3Q9UQE7 1217 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLA2R1Q13018 1463 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0J9YXY3 114 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACSL4O60488 711 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLN5O75503 358 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUDT17P0C025 328 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UCP1P25874 307 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCAF7P61962 342 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACTA2P62736 377 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACTC1P68032 377 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ROR1Q01973 937 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DEFB116Q30KQ4 102 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UNC5DQ6UXZ4 953 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS48Q7RTY5 328 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM110Q86TL2 294 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GCNT2Q8N0V5 402 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR51G1Q8NGK1 321 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR6X1Q8NH79 312 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXO25Q8TCJ0 367 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALG9Q9H6U8 611 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GORASP2Q9H8Y8 452 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ONECUT1Q9UBC0 465 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANAPC2Q9UJX6 822 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMB11A5LHX3 300 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 K7ERI5 159 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TYROBPO43914 113 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANXA9O76027 345 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GBAP04062 536 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UGT1A5P35504 534 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GP5P40197 560 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCR4P51679 360 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPS8Q12929 822 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCAF12Q5T6F0 453 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 METTL11BQ5VVY1 283 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHBDD2Q6NTF9 364 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CXCL17Q6UXB2 119 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF165Q6ZSG1 346 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C17orf64Q86WR6 236 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DUSP18Q8NEJ0 188 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GOLGA5Q8TBA6 731 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEPT8Q92599 483 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCED1BQ96HM7 432 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRAM1Q96QH2 718 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LHX9Q9NQ69 397 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ETV7Q9Y603 341 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MUC5ACP98088 5654 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms