RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	DCT	P40126	519 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTR1B	P42025	376 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LIMS1	P48059	325 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	BLK	P51451	505 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS6KA3	P51812	740 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTR1A	P61163	376 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PLIN5	Q00G26	463 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MC1R	Q01726	317 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TGM3	Q08188	693 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IL18R1	Q13478	541 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FZD2	Q14332	565 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT33B	Q14525	404 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	EMC4	Q5J8M3	183 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZS52	159 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF44	Q7L0R7	432 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C1QL4	Q86Z23	238 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NAGS	Q8N159	534 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO30	Q8TB52	745 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LCN9	Q8WX39	176 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NCLN	Q969V3	563 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TMBIM1	Q969X1	311 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN23	Q96B33	292 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MOAP1	Q96BY2	351 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PEX11G	Q96HA9	241 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2A14	Q96R47	310 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2A5	Q96R48	311 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SEPHS2	Q99611	448 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MYOC	Q99972	504 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DPH7	Q9BTV6	452 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	DOHH	Q9BU89	302 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NLN	Q9BYT8	704 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCG4	Q9H172	646 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	XKR8	Q9H6D3	395 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	THSD1	Q9NS62	852 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MYOT	Q9UBF9	498 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FEZF1	A0PJY2	475 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	C4orf51	C9J302	202 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247		G3V2T6	193 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PDLIM1	O00151	329 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	PLOD2	O00469	737 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	TXNDC9	O14530	226 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	B4GALT2	O60909	372 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFS2	O75306	463 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	BMP10	O95393	424 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CST1	P01037	141 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNA14	P01570	189 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	GBA	P04062	536 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	THRB	P10828	461 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGAM	P11215	1152 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ETFA	P13804	333 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF23	P17027	643 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	FPR1	P21462	350 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATG4A-208	ENST00000489247	CD27	P26842	260 aa		5.22	□□□□□ -1.57

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