RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 CDK15Q96Q40 435 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ZNF559Q9BR84 538 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RNF11Q9Y3C5 154 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ASB4Q9Y574 426 aa11.62□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 A0A0A6YYD5 115 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 KLF11O14901 512 aa11.61□□□□□ -0.55
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PRAME-212ENST00000485532 SUSD5O60279 629 aa11.61□□□□□ -0.55
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PRAME-212ENST00000485532 IMPDH1P20839 514 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SERPINB1P30740 379 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SSTR4P31391 388 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 BSGP35613 385 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 PIK3CBP42338 1070 aa11.61□□□□□ -0.55
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PRAME-212ENST00000485532 SLC37A1P57057 533 aa11.61□□□□□ -0.55
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PRAME-212ENST00000485532 BST1Q10588 318 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 MYBPHQ13203 477 aa11.61□□□□□ -0.55
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PRAME-212ENST00000485532 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 LIPJQ5W064 366 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 BICRALQ6AI39 1079 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RNF111Q6ZNA4 994 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 CCNYL1Q8N7R7 359 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A8Q8TCC7 542 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 GSTO2Q9H4Y5 243 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 IPPKQ9H8X2 491 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ACTR8Q9H981 624 aa11.61□□□□□ -0.55
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PRAME-212ENST00000485532 PHF11Q9UIL8 331 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 EXPH5Q8NEV8 1989 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 TMEM114B3SHH9 223 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 H0YIV9 168 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ITM2AO43736 263 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 GPR75O95800 540 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 AIFM1O95831 613 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 FBXO45P0C2W1 286 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 CT62P0C5K7 136 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 NR2F6P10588 404 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 GRK2P25098 689 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RIPPLY3P57055 190 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 GNGT1P63211 74 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 STX3Q13277 289 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 WLSQ5T9L3 541 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SEM1Q6ZVN7 128 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 SLC29A4Q7RTT9 530 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 WDR20Q8TBZ3 569 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 RIT1Q92963 219 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ZFP64Q9NPA5 681 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ADGRE2Q9UHX3 823 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 ADAM21Q9UKJ8 722 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 PCTPQ9UKL6 214 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa11.6□□□□□ -0.55
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