RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 ITPAQ9BY32 194 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 RAB17Q9H0T7 212 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 EXO5Q9H790 373 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 JKAMPQ9P055 326 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 MED12LQ86YW9 2145 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 STX16O14662 325 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ZWINTO95229 277 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CD1EP15812 388 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CHN1P15882 459 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 BMP5P22003 454 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 GCAP28676 217 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TIMP3P35625 211 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 XKP51811 444 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 FOXF2Q12947 444 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TMEM81Q6P7N7 255 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CYP20A1Q6UW02 462 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CCDC91Q7Z6B0 441 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 RELL1Q8IUW5 271 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 C7orf57Q8NEG2 295 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 C17orf47Q8NEP4 570 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 DCAKDQ8WVC6 231 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 RNF138Q8WVD3 245 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TMEM41AQ96HV5 264 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 SERPINI1Q99574 410 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 VPS11Q9H270 941 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ANKRA2Q9H9E1 313 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 GALNT9Q9HCQ5 603 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 HEY2Q9UBP5 337 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 B4GALT7Q9UBV7 327 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 C2orf72A6NCS6 295 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 A6NNC1 897 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 A8MT66 165 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 GNB5O14775 395 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 UGT2B11O75310 529 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 PDYNP01213 254 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ATP1B1P05026 303 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TYK2P29597 1187 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 EMDP50402 254 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ASCL1P50553 236 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CDH13P55290 713 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 PRSS53Q2L4Q9 553 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 FLYWCH1Q4VC44 716 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TBCELQ5QJ74 424 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TIGD3Q6B0B8 471 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CDC20BQ86Y33 519 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 LACC1Q8IV20 430 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 WDSUB1Q8N9V3 476 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 OR4K14Q8NGD5 310 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 NINJ1Q92982 152 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 REPS1Q96D71 796 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CENPKQ9BS16 269 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 EHD3Q9NZN3 535 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 ADAM29Q9UKF5 820 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 PLLPQ9Y342 182 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CD8B2A6NJW9 211 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 HSPB2A8KAH6 182 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 AHRRA9YTQ3 701 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 SNPHO15079 494 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 DYRK3O43781 588 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 PPM1BO75688 479 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 PCSK2P16519 638 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 NT5EP21589 574 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 TACR1P25103 407 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CNTFP26441 200 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 PIK3R1P27986 724 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 UQCRC1P31930 480 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 FEN1P39748 380 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 KIR2DL3P43628 341 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 HTR6P50406 440 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 CCNG1P51959 295 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-216ENST00000480665 RAE1P78406 368 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms