RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RAD54L	Q92698	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LITAF	Q99732	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TACC2	O95359	2948 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PLOD2	O00469	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC22A2	O15244	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CLIC2	O15247	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CLDN1	O95832	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TNNC2	P02585	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KRT7	P08729	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	VPREB1	P12018	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CHRNB4	P30926	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MC5R	P33032	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	UGT1A5	P35504	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PRPH	P41219	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CASP4	P49662	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RALGDS	Q12967	914 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OMD	Q99983	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SVIL	O95425	2214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC31A1	O15431	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DUX1	O43812	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SSX4	O60224	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TBL1X	O60907	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZWINT	O95229	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CD48	P09326	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LIF	P15018	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CSK	P41240	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NPY4R	P50391	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NDST1	P52848	882 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TNNC1	P63316	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ASIC1	P78348	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	C1orf61	Q13536	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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