RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 POLG2Q9UHN1 485 aa3.65□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 LIPT1Q9Y234 373 aa3.65□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF711Q9Y462 761 aa3.65□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.65□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 COL7A1Q02388 2944 aa3.65□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PLXNB1O43157 2135 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0J9YVX5 310 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 CD8B2A6NJW9 211 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS47A8MTI9 375 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 TARM1B6A8C7 271 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 SSX4O60224 188 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 CTSVO60911 334 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 SPDEFO95238 335 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PIRTP0C851 137 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM225BP0DP42 221 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT3P12035 628 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 DPP4P27487 766 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 CDKN1AP38936 164 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PCYT1AP49585 367 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT6P53370 316 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A3Q00325 362 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC63Q05C16 580 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 RPA4Q13156 261 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 SCGB2A2Q13296 93 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PTK6Q13882 451 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS6KA2Q15349 733 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 NSDHLQ15738 373 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 BAK1Q16611 211 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP1B1Q16678 543 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 SYT16Q17RD7 645 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL7AQ4VC05 210 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 BEX5Q5H9J7 111 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 NAA35Q5VZE5 725 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 GJB7Q6PEY0 223 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 TMCO3Q6UWJ1 677 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 NT5DC3Q86UY8 548 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 TEX26Q8N6G2 289 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 IL17DQ8TAD2 202 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 DTX3LQ8TDB6 740 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ST8SIA4Q92187 359 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 MARK4Q96L34 752 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 C7orf26Q96N11 449 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ADOQ96SZ5 270 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM173AQ9BQD7 235 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ALG8Q9BVK2 526 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 DRC3Q9H069 523 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PIGMQ9H3S5 423 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 COG4Q9H9E3 785 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 GLOD4Q9HC38 313 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 IL26Q9NPH9 171 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 SMOXQ9NWM0 555 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 HPF1Q9NWY4 346 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ARL15Q9NXU5 204 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 AMACRQ9UHK6 382 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJC12Q9UKB3 198 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 ASF1AQ9Y294 204 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa3.64□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0G2JMM0 328 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1W2PP18 115 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1W2PPB8 328 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1W2PRS3 328 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 KIR3DP1A8MWS1 328 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 A8MXE2 369 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 VWC2LB2RUY7 222 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 STX16O14662 325 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFS7O75251 213 aa3.63□□□□□ -1.83
ECHDC1-211ENST00000460558 CSF1P09603 554 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms