RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430853.5

TTC28-AS1-211, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 564 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-211ENST00000430853 VPS33AQ96AX1 596 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PHF12Q96QT6 1004 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NUDT9Q9BW91 350 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DEFB126Q9BYW3 111 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LHPPQ9H008 270 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SERHLQ9NQF3 203 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 VPS4AQ9UN37 437 aa12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 A0A096LPI6 279 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARGFXA6NJG6 315 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CAPN14A8MX76 684 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 UPK1AO00322 258 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PSMG1O95456 288 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CBX7O95931 251 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SSTR4P31391 388 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MC3RP41968 323 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CCT3P49368 545 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CDK9P50750 372 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RNF4P78317 190 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 Q0VFX4 171 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MYBPC3Q14896 1274 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SPDYE7PQ495Y7 208 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BORAQ6PGQ7 559 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GK5Q6ZS86 529 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ANKRD46Q86W74 232 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GALNT16Q8N428 558 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SLC5A8Q8N695 610 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C17orf47Q8NEP4 570 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR52R1Q8NGF1 315 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TP53INP1Q96A56 240 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CXorf36Q9H7Y0 433 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARMCX1Q9P291 453 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BCAP29Q9UHQ4 241 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TEKT2Q9UIF3 430 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SNX8Q9Y5X2 465 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 USP24Q9UPU5 2620 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DOCK10Q96BY6 2186 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HRKO00198 91 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CEACAM4O75871 244 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KCNH1O95259 989 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ANP32DO95626 131 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CLPSP04118 112 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KRT16P08779 473 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 COX4I1P13073 169 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PPIBP23284 216 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ITGA3P26006 1051 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRIM2P49643 509 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EMDP50402 254 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CXADRP78310 365 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KRT72Q14CN4 511 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MMEL1Q495T6 779 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C6orf10Q5SRN2 563 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LRIF1Q5T3J3 769 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF621Q6ZSS3 439 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SNX32Q86XE0 403 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CDRT4Q8N9R6 151 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NUP43Q8NFH3 380 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C16orf52Q8NHV5 167 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MS4A4EQ96PG1 132 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GIN1Q9NXP7 522 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GMEB1Q9Y692 573 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ASPDHA6ND91 283 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KRT75O95678 551 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ITGAMP11215 1152 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DRD5P21918 477 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PPICP45877 212 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MNAT1P51948 309 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EBPQ15125 230 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MEP1AQ16819 746 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CRB2Q5IJ48 1285 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SLC2A7Q6PXP3 512 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GPR155Q7Z3F1 870 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TREML1Q86YW5 311 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C9orf40Q8IXQ3 194 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SLC15A4Q8N697 577 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FITM2Q8N6M3 262 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF321PQ8N8H1 164 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ADIPOR1Q96A54 375 aa12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms