RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 SLAMF1Q13291 335 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.62e-46■□□□□ 9
PRAME-204ENST00000403441 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 UNC50Q53HI1 259 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 RNF111Q6ZNA4 994 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 GPR180Q86V85 440 aa11.33□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.33□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CBLCQ9ULV8 474 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CAPN14A8MX76 684 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 HRKO00198 91 aa11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 TP53I11O14683 189 aa11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 LRATO95237 230 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 EPPINO95925 133 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 OTCP00480 354 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 IL2RAP01589 272 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RAF1P04049 648 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TAC1P20366 129 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TACR1P25103 407 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 BSGP35613 385 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TIMP3P35625 211 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SLCO1A2P46721 670 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CCNG1P51959 295 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ERVK-8P63133 956 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 PHEXP78562 749 aa11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 FRG2Q64ET8 278 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TMEM198Q66K66 360 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 LYPD8Q6UX82 237 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SEM1Q6ZVN7 128 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 MMP21Q8N119 569 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NAXEQ8NCW5 288 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TNIP2Q8NFZ5 429 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 OR4F6Q8NGB9 312 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 DIO2Q92813 273 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 RIT1Q92963 219 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 FRG2BQ96QU4 278 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ZNF382Q96SR6 550 aa11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 OR51B5Q9H339 312 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TRPS1Q9UHF7 1281 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ERVK-19Q9WJR5 959 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 A0A0A6YYD5 115 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 TRAPPC6AO75865 159 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NR2F6P10588 404 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 CDH13P55290 713 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 SLC37A1P57057 533 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ADAM8P78325 824 aa11.31□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 DUSP8Q13202 625 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 KEAP1Q14145 624 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
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PRAME-204ENST00000403441 RPS6KA2Q15349 733 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 NTRK2Q16620 822 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 CCDC153Q494R4 210 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 C18orf63Q68DL7 685 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-204ENST00000403441 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.31□□□□□ -0.6
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