RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 MAGEB18Q96M61 343 aa25.16■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 KLHL1Q9NR64 748 aa25.16■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 GIMAP4Q9NUV9 329 aa25.16■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ABI3Q9P2A4 366 aa25.16■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 GABRR3A8MPY1 467 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF195O14628 629 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 TBX19O60806 448 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 STSP08842 583 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 G6PDP11413 515 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 PDE7AQ13946 482 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 OR1C1Q15619 314 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF385BQ569K4 471 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 C1QL3Q5VWW1 255 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 C9orf40Q8IXQ3 194 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC34Q8IZ02 419 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 CTHRC1Q96CG8 243 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 BBS4Q96RK4 519 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF639Q9UID6 485 aa25.15■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 UNC79Q9P2D8 2635 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 TRPC5OSA6NMA1 111 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 UNC5CO95185 931 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 LBPP18428 481 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 MPEG1Q2M385 716 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF628Q5EBL2 1059 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 GFRALQ6UXV0 394 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF111Q6ZNA4 994 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 RGS9BPQ6ZS82 235 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 FJX1Q86VR8 437 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 VWA5B2Q8N398 1253 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF615Q8N8J6 731 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 OR9A2Q8NGT5 310 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF675Q8TD23 568 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 BRINP2Q9C0B6 783 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 MYOTQ9UBF9 498 aa25.14■■□□□ 1.62
GNPTAB-202ENST00000392919 CRYABP02511 175 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 EPHA3P29320 983 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 DIO3P55073 304 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF787Q6DD87 383 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SIMC1Q8NDZ2 872 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJB8Q8NHS0 232 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 PPCDCQ96CD2 204 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 MTERF3Q96E29 417 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP6V1HQ9UI12 483 aa25.13■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA8OA6NCC3 632 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA8NF8WBI6 632 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ZG16O60844 167 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ITGA10O75578 1167 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 PCSK2P16519 638 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 MPIP34949 423 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 DUSP8Q13202 625 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OGFOD2Q6N063 350 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 RIMKLAQ8IXN7 391 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR7G1Q8NGA0 311 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR5L2Q8NGL0 311 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 NUBPLQ8TB37 319 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 NUDT8Q8WV74 236 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SCMH1Q96GD3 660 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR10A5Q9H207 317 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 GLIPR2Q9H4G4 154 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SH3BP4Q9P0V3 963 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 USH1CQ9Y6N9 552 aa25.12■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR6C76A6NM76 312 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 WWP2O00308 870 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 FCHO1O14526 889 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 NEURL1O76050 574 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 CBX7O95931 251 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 HPCAL1P37235 193 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.618e-6■■□□□ 13
GNPTAB-202ENST00000392919 EBPQ15125 230 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM47EQ6ZV65 393 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM9CQ8IZT9 166 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 KAT2AQ92830 837 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 AMDHD1Q96NU7 426 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SEC14L3Q9UDX4 400 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa25.11■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR2J2O76002 312 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
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