RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389825.7

GREB1-205, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 1,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-205ENST00000389825 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 ART5Q96L15 291 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 PHF12Q96QT6 1004 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 INPP5KQ9BT40 448 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 KCND3Q9UK17 655 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.72□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 PLOD2O00469 737 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 EMC8O43402 210 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 GSNP06396 782 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 OR4D2P58180 307 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 PSME3P61289 254 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SLC25A3Q00325 362 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 MAP4K2Q12851 820 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 CPZQ66K79 652 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 TMEM64Q6YI46 380 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 RINLQ6ZS11 566 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SFXN5Q8TD22 340 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 ZNF675Q8TD23 568 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 CT55Q8WUE5 264 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 ELP4Q96EB1 424 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SPSB2Q99619 263 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.71□□□□□ -0.05
GREB1-205ENST00000389825 SDK2Q58EX2 2172 aa14.71□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 A0A087WV62 115 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 CLIC1O00299 241 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 RECKO95980 971 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 LIPCP11150 499 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 DLSTP36957 453 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 STAT5AP42229 794 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 CDKN2CP42773 168 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 FOXK1P85037 733 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 DNASE1L3Q13609 305 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 SZRD1Q7Z422 152 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 SHISA5Q8N114 240 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 TSLPQ969D9 159 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 NACC2Q96BF6 587 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 VAPAQ9P0L0 249 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 TCFL5Q9UL49 500 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 CACNA1DQ01668 2161 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 OR2W5A6NFC9 320 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 PLOD3O60568 738 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 COQ9O75208 318 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 SOX30O94993 753 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 MAGEA8P43361 318 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 NCALDP61601 193 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 DUSP2Q05923 314 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 TP53BP2Q13625 1128 aa14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GREB1-205ENST00000389825 SSPNQ14714 243 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms