RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERASQ7Z444 233 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC16A10Q8TF71 515 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 EXTL1Q92935 676 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 OMDQ99983 421 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 CNPPD1Q9BV87 410 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 TREM1Q9NP99 234 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 TNS3Q68CZ2 1445 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 PAGE1O75459 146 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 KITP10721 976 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 BMP7P18075 431 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 AKT2P31751 481 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 TCL1AP56279 114 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 HERVK_113P63132 956 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 GBE1Q04446 702 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM62Q0P6H9 643 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPIN4Q56A73 249 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 METTL23Q86XA0 190 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYP4X1Q8N118 509 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF738Q8NE65 137 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR7D4Q8NG98 312 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF675Q8TD23 568 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 MEAF6Q9HAF1 191 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCDC167Q9P0B6 97 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 RABAC1Q9UI14 185 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 C3P01024 1663 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 MEGF11A6BM72 1044 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 E5RGE8 158 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARNTLO00327 626 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 TCAPO15273 167 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRATO95237 230 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM209BQ5JX69 171 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPRED1Q7Z699 444 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 XYLT1Q86Y38 959 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM104Q8NE00 496 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 PARD6AQ9NPB6 346 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 BRD7Q9NPI1 651 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A096LPK6 155 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP6CO00743 305 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 DVL1O14640 695 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 HLA-DQB1P01920 261 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 YWHAQP27348 245 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 CDC25CP30307 473 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SHC2P98077 582 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF266Q14584 549 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 PKN3Q6P5Z2 889 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 VITQ6UXI7 678 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 GALNT10Q86SR1 603 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCDC190Q86UF4 302 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 NAA40Q86UY6 237 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRRC46Q96FV0 321 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 PORCNQ9H237 461 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF639Q9UID6 485 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 FZD10Q9ULW2 581 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC1A7O00341 560 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 FZD6O60353 706 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 FUCA1P04066 466 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 HIST1H2ADP20671 130 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 FSHRP23945 695 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 ITPKBP27987 946 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 AHRP35869 848 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 C4orf17Q53FE4 359 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 MIIPQ5JXC2 388 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 Q5PR19 223 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 LIPIQ6XZB0 460 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 SERPINA11Q86U17 422 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 FIBINQ8TAL6 211 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 RASD2Q96D21 266 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 RTP4Q96DX8 246 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.29□□□□□ -1.88
PKHD1L1-201ENST00000378402 NPAS2Q99743 824 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms