RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF774Q6NX45 483 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOOLQ6UXV4 268 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR88Q6ZMY6 472 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEACAM19Q7Z692 300 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDM8Q8N371 416 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6T1Q8NGN1 323 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHYHIPQ92561 330 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB3CQ96E17 227 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM237Q96Q45 408 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN18Q96SJ8 248 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBWD1Q9BRT8 395 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTYH2Q9BSA4 534 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR174Q9BXC1 333 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLNQ9BYT8 704 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNMDQ9H2S6 317 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRN1Q9NPD7 142 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF446Q9NWS9 450 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF581Q9P0T4 197 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARMCX1Q9P291 453 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LHX3Q9UBR4 397 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIOXQ9UGB7 285 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLXQ9UH92 298 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMCNQ9ULC0 261 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA2G4CQ9UP65 541 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF24Q9Y225 148 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP24Q9Y5R2 645 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM205AQ6ZU69 1335 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF318Q5VUA4 2279 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATRXP46100 2492 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRABD2BA6NFA1 517 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPIPA5E9PKD4 350 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 EI24O14681 340 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCL2L11O43521 198 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSX5O60225 188 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE5AO76074 875 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-ATP6P00846 226 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OAS1P00973 400 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHG3P01860 377 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GP9P14770 177 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACP1P24666 158 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC6A8P48029 635 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGDIAP52565 204 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 STARD6P59095 220 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAMTQ14353 236 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABRAXAS2Q15018 415 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDK1Q15118 436 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF528Q3MIS6 628 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A6Q4U2R8 563 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEL1L2Q5TEA6 688 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAF3Q5VWG9 929 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNLSQ5VYX0 342 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM219BQ5XKK7 198 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPINK14Q6IE38 97 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6B2Q6IFH4 312 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEK5Q6P3R8 708 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OLFM4Q6UX06 510 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFSD7Q6UXD7 560 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 STOX1Q6ZVD7 989 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERINC5Q86VE9 423 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPBP1Q86WP2 473 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HPS6Q86YV9 775 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HDDC3Q8N4P3 179 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHOXF1Q8NHV9 184 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF671Q8TAW3 534 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBCKQ8TEA7 893 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGAP11Q8TF27 550 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 LHX4Q969G2 390 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM186Q96B77 213 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTNG2Q96CW9 530 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOOQ9BUR5 198 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATG10Q9H0Y0 220 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBP1Q9H171 429 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM231Q9H6L2 316 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRL4Q9HBW9 690 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPMQ9NSP4 180 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CUTCQ9NTM9 273 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLIP2Q9UDT6 1046 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCAP29Q9UHQ4 241 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ODF2LQ9ULJ1 636 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms