RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 CELF2O95319 508 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLU7O95391 586 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A27O95847 323 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPIAL4FP0DN26 164 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GLRA1P23415 457 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 UCP1P25874 307 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXD10P28358 340 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPAN7P41732 249 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIR2DS4P43632 304 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSNK1DP48730 415 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 POU3F4P49335 361 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPP38P78345 283 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACSM1Q08AH1 577 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPYSL3Q14195 570 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT31Q15323 416 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZIC1Q15915 447 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NTRK2Q16620 822 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC57Q2TAC2 916 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUSP28Q4G0W2 176 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCST2Q5T1A1 773 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM46CQ5VWP2 391 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 UFSP1Q6NVU6 142 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6ZR03 302 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM26Q6ZUK4 368 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MOB2Q70IA6 237 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NRARPQ7Z6K4 114 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R27Q86WC6 154 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 C9orf40Q8IXQ3 194 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MCOLN2Q8IZK6 566 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYT14Q8NB59 555 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q8NDZ9 215 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUSP18Q8NEJ0 188 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAP25Q8TEE9 199 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCP11Q8WWU5 503 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM158Q8WZ71 300 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMARCD2Q92925 531 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPSB1Q96BD6 273 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 BIRC7Q96CA5 298 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCED1BQ96HM7 432 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP170P1Q96L14 293 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM173AQ9BQD7 235 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TM2D1Q9BX74 207 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXXC4Q9H2H0 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FN3KQ9H479 309 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF665Q9H7R5 613 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 VIPAS39Q9H9C1 493 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LHX9Q9NQ69 397 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NANSQ9NR45 359 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GIMAP4Q9NUV9 329 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CIDEBQ9UHD4 219 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF391Q9UJN7 358 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GGA2Q9UJY4 613 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FZR1Q9UM11 496 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEX264Q9Y6I9 313 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLA2R1Q13018 1463 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1B0GW55 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC162PA2VCL2 907 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCSO14618 274 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 BET1O15155 118 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACSL4O60488 711 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPAG7O75391 227 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGR2O95994 175 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52Z1P0C646 297 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 CISD3P0C7P0 127 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUX4L2P0CJ85 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUX4L3P0CJ86 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUX4L5P0CJ88 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUX4L6P0CJ89 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUX4L7P0CJ90 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 UQCRC2P22695 453 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJB2P29033 226 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 UGT1A5P35504 534 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGS7P49802 495 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 MFAP3P55082 362 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTTPP55157 894 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 MC1RQ01726 317 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABRQ12979 859 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD226Q15762 336 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms