RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 CDH20Q9HBT6 801 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 VNN3Q9NY84 501 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SOBPA7XYQ1 873 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HLA-FP30511 346 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC14A2Q15849 920 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TEX26Q8N6G2 289 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 LINC01553A4QN01 128 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PRSS56P0CW18 603 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 XCR1P46094 333 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ADAM15Q13444 863 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TRAM1Q15629 374 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 UEVLDQ8IX04 471 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CD200R1Q8TD46 325 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ELP5Q8TE02 316 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM19Q96HH6 336 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MED11Q9P086 117 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DISC1C4P0D8 188 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RDH16O75452 317 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CELP19835 753 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR8K3Q8NH51 312 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 POT1Q9NUX5 634 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DHDHQ9UQ10 334 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 C4BP0C0L5 1744 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC6A8P48029 635 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IER5LQ5T953 404 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TIGD4Q8IY51 512 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 FN3KQ9H479 309 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PLOD2O00469 737 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MAOBP27338 520 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MLLT10P55197 1068 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 BLMHQ13867 455 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZBED5Q49AG3 693 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RAB41Q5JT25 222 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 EID2Q8N6I1 236 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR10A4Q9H209 315 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HCSTQ9UBK5 93 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DKK3Q9UBP4 350 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ANTXRLA6NF34 631 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 GGT3PA6NGU5 568 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 YKT6O15498 198 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CERS1P27544 350 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MEP1AQ16819 746 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZIC5Q96T25 663 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CHIAQ9BZP6 476 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 RDH14Q9HBH5 336 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 PHYHO14832 338 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 OR2T1O43869 369 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 LAMP1P11279 417 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HK3P52790 923 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 COQ5Q5HYK3 327 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-202ENST00000348962 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms