RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFAF1Q9Y375 327 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OARD1Q9Y530 152 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GMNCA6NCL1 334 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GJE1A6NN92 205 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HAX1O00165 279 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CHUKO15111 745 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ASNA1O43681 348 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PGM3O95394 542 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 UROSP10746 265 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 IMPDH2P12268 514 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MTHFD2P13995 350 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 B4GALNT1Q00973 533 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PMP22Q01453 160 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CD47Q08722 323 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FAPQ12884 760 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EFR3AQ14156 821 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ARMC3Q5W041 872 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LGI4Q8N135 537 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BANPQ8N9N5 519 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GPR22Q99680 433 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PINK1Q9BXM7 581 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SMOXQ9NWM0 555 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 K7ENP7 123 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SULT2B1O00204 365 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MANBAO00462 879 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SNPHO15079 494 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0513O60268 411 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GABRB3P28472 473 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RRM2P31350 389 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EMP3P54852 163 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PMPCAQ10713 525 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CLN3Q13286 438 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FAM53BQ14153 422 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RTP5Q14D33 572 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DEF8Q6ZN54 512 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA24Q86W54 205 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NUP43Q8NFH3 380 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SNX33Q8WV41 574 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TWIST2Q8WVJ9 160 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MARK4Q96L34 752 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 G6PC3Q9BUM1 346 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ADI1Q9BV57 179 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DSN1Q9H410 356 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HHATLQ9HCP6 504 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CHST11Q9NPF2 352 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CALML5Q9NZT1 146 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SH3GLB1Q9Y371 365 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DOCK7Q96N67 2140 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CDH23Q9H251 3354 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HIVEP2P31629 2446 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CHD9Q3L8U1 2897 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 H0YIG0 161 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TPST1O60507 370 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLCO2B1O94956 709 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PAPLNO95428 1278 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CRHR1P34998 444 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SCTRP47872 440 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ERFP50548 548 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RASSF2P50749 326 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HSD17B7P56937 341 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 XIAPP98170 497 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF763Q0D2J5 394 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NADK2Q4G0N4 442 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CARD17Q5XLA6 110 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS42Q7Z5A4 293 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GPR137CQ8N3F9 429 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR52R1Q8NGF1 315 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RAB8BQ92930 207 aa4.15□□□□□ -1.74
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