RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333496.14

CLN3-201, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-201ENST00000333496 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 PIP5K1BO14986 540 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 CBX7O95931 251 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 FAM107AO95990 144 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 CHEK2O96017 543 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 CCL3P10147 92 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 GUCY1A3Q02108 690 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 GFRALQ6UXV0 394 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 RTL4Q6ZR62 310 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 SLC15A4Q8N697 577 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 BIRC5O15392 142 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 AGFG2O95081 481 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 NEFHP12036 1026 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 PCSK2P16519 638 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 GPX3P22352 226 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 CHI3L2Q15782 390 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 XKR7Q5GH72 579 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 DDIASQ8IXT1 998 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 ZNF675Q8TD23 568 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 TP53INP1Q96A56 240 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 SGCZQ96LD1 299 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 C3orf30Q96M34 536 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 GPR137Q96N19 417 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 LRRK2Q5S007 2527 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 G3V3Y1 287 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 ZWINTO95229 277 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 STSP08842 583 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 FBXO45P0C2W1 286 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 ZNF24P17028 368 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 EMDP50402 254 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 TMEM64Q6YI46 380 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 OR2M7Q8NG81 312 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 KAT2AQ92830 837 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CLN3-201ENST00000333496 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 ASNA1O43681 348 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 SERPINE1P05121 402 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 SDC1P18827 310 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 CNR1P21554 472 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 NTRK2Q16620 822 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 GALNTL6Q49A17 601 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 HOMEZQ8IX15 550 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 ITPAQ9BY32 194 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 PROK2Q9HC23 129 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 PTPN13Q12923 2485 aa14.58□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 TMEM120BA0PK00 339 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 WIPF3A6NGB9 483 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 ZNHIT1O43257 154 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 HS6ST1O60243 411 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 ATP6AP2O75787 350 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 DNASE1L1P49184 302 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN3-201ENST00000333496 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms