RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GSTM3P21266 225 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 AHCYP23526 432 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 VAMP1P23763 118 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 AOAHP28039 575 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 MPIP34949 423 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 BTN3A2P78410 334 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 RBBP4Q09028 425 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 OAFQ86UD1 273 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TEX26Q8N6G2 289 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC39A13Q96H72 371 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 WDR45Q9Y484 360 aa14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 A0A1W2PRQ8 180 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ADAP00813 363 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ALDOBP05062 364 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 UQCRC2P22695 453 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FAPQ12884 760 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC14A2Q15849 920 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SMPDL3AQ92484 453 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CCDC115Q96NT0 180 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TNFRSF10AO00220 468 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 HTR1AP08908 422 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ACVR2AP27037 513 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 VIPR1P32241 457 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GJA5P36382 358 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CCR8P51685 355 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GRIN2CQ14957 1233 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FCN2Q15485 313 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 KRT77Q7Z794 578 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 MBD2Q9UBB5 411 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 A0A0G2JPF8 293 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SH3D21A4FU49 640 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FLRT2O43155 660 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GALTP07902 379 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 LHCGRP22888 699 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GAB1Q13480 694 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SERINC5Q86VE9 423 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 RASD1Q9Y272 281 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF623O75123 536 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FBXO45P0C2W1 286 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ARHGDIBP52566 201 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 RGS1Q08116 209 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 HES5Q5TA89 166 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 OR8K5Q8NH50 307 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SPACA7Q96KW9 195 aa14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SCN7AQ01118 1682 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PRSS23O95084 383 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PAHP00439 452 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 MT-ND4P03905 459 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GIPRP48546 466 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SPINT3P49223 89 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 AP3S2P59780 193 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SAMD8Q96LT4 415 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 IGFLR1Q9H665 355 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 MAGEA11P43364 429 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PGDP52209 483 aa14.91□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SKP1P63208 163 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms