RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NETO2Q8NC67 525 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 MED18Q9BUE0 208 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 HDHD5Q9BXW7 423 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 BCO2Q9BYV7 579 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 M0R2N6 131 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ARVCFO00192 962 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NRP1O14786 923 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PIRTP0C851 137 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 AKT2P31751 481 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CAMK2BQ13554 666 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NSMAFQ92636 917 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SLC30A3Q99726 388 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 WDR26Q9H7D7 661 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RGS13O14921 159 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ALPPL2P10696 532 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ITPKAP23677 461 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PTH2RP49190 550 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CRISP3P54108 245 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CDK6Q00534 326 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OR4F3Q6IEY1 312 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GDPD3Q7L5L3 318 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NLRC3Q7RTR2 1065 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 KREMEN2Q8NCW0 462 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SLC7A13Q8TCU3 470 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CDC6Q99741 560 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GALNT9Q9HCQ5 603 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ZFP57Q9NU63 452 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM72A0PK05 275 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ADORA3P0DMS8 318 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF30P17039 623 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CPOXP36551 454 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ACTBP60709 375 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ACTG1P63261 375 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 WNT9AO14904 365 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 RCBTB2O95199 551 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 IFNA5P01569 189 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 HRGP04196 525 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 NPY5RQ15761 445 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FRZBQ92765 325 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 OSTF1Q92882 214 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 HMCESQ96FZ2 354 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 IL12RB2Q99665 862 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PRB8 838 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 FAM170BA6NMN3 283 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 ADAP00813 363 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 BDKRB2P30411 391 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 IGFALSP35858 605 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 DGKEP52429 567 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SPRED1Q7Z699 444 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 LHFPL5Q8TAF8 219 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 STYXL1Q9Y6J8 313 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 MYH7BA7E2Y1 1941 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0U1RQF3 1178 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 GLP1RP43220 463 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CLCN7P51798 805 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 DSC2Q02487 901 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CARD16Q5EG05 197 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 HIST2H3AQ71DI3 136 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SERPINA9Q86WD7 417 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 TFAP2BQ92481 460 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 PYCR2Q96C36 320 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SLC29A3Q9BZD2 475 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRO-201ENST00000281171 SIX6O95475 246 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 KHKP50053 298 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ART1P52961 327 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 KCNC4Q03721 635 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CDONQ4KMG0 1287 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 NHSL2Q5HYW2 709 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF678Q5SXM1 525 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PLAG1Q6DJT9 500 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ENPP6Q6UWR7 440 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ENPP7Q6UWV6 458 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 OR6K6Q8NGW6 343 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 KCNH6Q9H252 994 aa13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms