RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TFECO14948 347 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 UGT2B7P16662 529 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CMPK1P30085 196 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PTGR1Q14914 329 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ADCK2Q7Z695 626 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 OR2I1PQ8NGU4 316 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RSC1A1Q92681 617 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A18Q96BI1 424 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 REPS1Q96D71 796 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC6A14Q9UN76 642 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL20Q9Y2M5 609 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 FEZF1A0PJY2 475 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SERTM1A2A2V5 107 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEB17A8MXT2 336 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CCNDBP1O95273 360 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 IGFBP5P24593 272 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF33BQ06732 778 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLAMF1Q13291 335 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LAPTM4AQ15012 233 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 KRT78Q8N1N4 520 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 OR8J3Q8NGG0 315 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SAP25Q8TEE9 199 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SNAPC3Q92966 411 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 DPH7Q9BTV6 452 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SMOC1Q9H4F8 434 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 UCK1Q9HA47 277 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 HRASLS2Q9NWW9 162 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D24Q9ULP9 559 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TYRP1P17643 537 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RFX4Q33E94 735 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 VN1R5Q7Z5H4 357 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35F3Q8IY50 421 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PPP3R2Q96LZ3 170 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NARFLQ9H6Q4 476 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GORASP2Q9H8Y8 452 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RASSF1Q9NS23 344 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PEX16Q9Y5Y5 336 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 OR5K3A6NET4 321 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf74A8MZ97 194 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TPPPO94811 219 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 EPN2O95208 641 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ITGAMP11215 1152 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MPLP40238 635 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1CAP62136 330 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 OOSP2Q86WS3 158 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD53Q8N9V6 530 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC13A3Q8WWT9 602 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GTF2H4Q92759 462 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 FAM162AQ96A26 154 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM45AQ9NWC5 275 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 FKBP14Q9NWM8 211 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GMPPBQ9Y5P6 360 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 A3GALT2U3KPV4 340 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MEIOCA2RUB1 952 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 HMX3A6NHT5 357 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LILRA5A6NI73 299 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SNX4O95219 450 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ETHE1O95571 254 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 IL7P13232 177 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 IFI30P13284 250 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RPL38P63173 70 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CYP4F3Q08477 520 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 IDO2Q6ZQW0 420 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 TTC9Q92623 222 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2E3Q969T4 207 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC115Q96NT0 180 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC38A3Q99624 504 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PRRG3Q9BZD7 231 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 BRF2Q9HAW0 419 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 LRTM1Q9HBL6 345 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 DMRT3Q9NQL9 472 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 NLGN3Q9NZ94 848 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RNF215Q9Y6U7 377 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP33O14559 1287 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 UBXN7O94888 489 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CXCR4P61073 352 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RPS13P62277 151 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA0040Q15053 153 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF425Q6IV72 752 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC51BQ86UW2 128 aa19.17■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 Q96MT0 163 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms