RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TEKQ02763 1124 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CD47Q08722 323 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FADDQ13158 208 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK5R2Q13319 367 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF846Q147U1 533 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOCQ15369 112 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2A13Q16696 494 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MEP1AQ16819 746 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DGUOKQ16854 277 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT8Q16880 541 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG11Q2TAA5 492 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZVL8 140 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD46Q86W74 232 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SPARTQ8N0X7 666 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TMIEQ8NEW7 156 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FNDC8Q8TC99 324 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FCGR1BQ92637 280 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PYCR2Q96C36 320 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 COQ8BQ96D53 544 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR34Q96EX3 536 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 QRFPRQ96P65 431 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MBOAT4Q96T53 435 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 INPP5KQ9BT40 448 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCG8Q9H221 673 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 REEP4Q9H6H4 257 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HMG20AQ9NP66 347 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LUZP4Q9P127 313 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PPT2Q9UMR5 302 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TACC2O95359 2948 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0J9YVX5 310 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM247A6NEH6 219 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2AG2A6NM03 316 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 E7EQ34 232 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 AREL1O15033 823 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN6O43657 245 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH7O60245 1069 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM20BO75063 409 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ATE1O95260 518 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ARAFP10398 606 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GLB1P16278 677 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TCN2P20062 427 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KELP23276 732 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TACR1P25103 407 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ETV3P41162 512 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR1P46091 355 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1D5P58170 312 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ISL1P61371 349 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PHC1P78364 1004 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RPA4Q13156 261 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 E2F2Q14209 437 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IRF4Q15306 451 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NPTX1Q15818 432 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NKG7Q16617 165 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GTDC1Q4AE62 458 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IFI44LQ53G44 452 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PYCR3Q53H96 274 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.64□□□□□ -1.35
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