RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 G6PDP11413 515 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 NME2P22392 152 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MAPK1P28482 360 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 DIO3P55073 304 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 PMP22Q01453 160 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 INAQ16352 499 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MAVSQ7Z434 540 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SLC15A4Q8N697 577 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 HORMAD2Q8N7B1 307 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 FAR1Q8WVX9 515 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 ERP27Q96DN0 273 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 MTERF3Q96E29 417 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 SH2D2AQ9NP31 389 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-201ENST00000236273 A8MVJ9 347 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PLOD2O00469 737 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 HDAC3O15379 428 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 RASAL1O95294 804 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 KITP10721 976 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 C17orf47Q8NEP4 570 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PPCDCQ96CD2 204 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ITPAQ9BY32 194 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 DEPPQ9NTK1 212 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 HPF1Q9NWY4 346 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SH3BP4Q9P0V3 963 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SVILO95425 2214 aa20.57■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 WISP1O95388 367 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 FBXO45P0C2W1 286 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 C21orf58P58505 322 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 OPN5Q6U736 354 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TMEM64Q6YI46 380 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SULF2Q8IWU5 870 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TMEM178AQ8NBL3 297 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 COQ8BQ96D53 544 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ELP4Q96EB1 424 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 C5orf34Q96MH7 638 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 MYO18BQ8IUG5 2567 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WV62 115 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 UPK1AO00322 258 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD28O15084 1053 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PSMG1O95456 288 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CBX6O95503 412 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 LAMP1P11279 417 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 MST1P26927 711 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TDGF1P3P51864 188 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CLDN8P56748 225 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 RNFT1Q5M7Z0 435 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 OGFOD2Q6N063 350 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TMEM107Q6UX40 140 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A8Q8TCC7 542 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 VSTM2LQ96N03 204 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 C7orf26Q96N11 449 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 FRMD6Q96NE9 622 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CFL2Q9Y281 166 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PINLYPA6NC86 204 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 PDPK1O15530 556 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 VPS4BO75351 444 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 LBPP18428 481 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 EPHA3P29320 983 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 NTSP30990 170 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 MC3RP41968 323 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 UQCRFS1P47985 274 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 OR2L13Q8N349 312 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 BCORP1Q8N888 145 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-201ENST00000236273 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms