RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	NCLN	Q969V3	563 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LRGUK	Q96M69	825 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CATSPER2	Q96P56	530 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	DGAT2	Q96PD7	388 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNK13	Q9HB14	408 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR83	Q9NYM4	423 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	GABRR3	A8MPY1	467 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	OR10H2	O60403	315 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	GUCY1B2	O75343	617 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CLPS	P04118	112 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ITGB2	P05107	769 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CYC1	P08574	325 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	DRD2	P14416	443 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LBP	P18428	481 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TNNI3	P19429	210 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SSTR4	P31391	388 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CD97	P48960	835 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR143	P51810	404 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SEC24C	P53992	1094 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PLIN5	Q00G26	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	MGAT2	Q10469	447 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	DUSP8	Q13202	625 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PDE7A	Q13946	482 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	KAT2A	Q92830	837 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	NACC2	Q96BF6	587 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	IP6K3	Q96PC2	410 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	REEP4	Q9H6H4	257 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	BLACE	A4D250	179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634		A8MUI8	341 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SERPINA7	P05543	415 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC35E2	P0CK97	266 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LAMP1	P11279	417 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	NT5E	P21589	574 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	UFM1	P61960	85 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SERTAD2	Q14140	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	OGFOD2	Q6N063	350 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ELP5	Q8TE02	316 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF721	Q8TF20	911 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	RIT1	Q92963	219 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	AIG1	Q9NVV5	245 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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