RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637548.1

ARID1B-226, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

Gene ARID1B, Length 2,255 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-226	ENST00000637548	THOP1	P52888	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TAS2R39	P59534	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CDK3	Q00526	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PDE1B	Q01064	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ACVR1	Q04771	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SNCB	Q16143	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	AANAT	Q16613	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GSTA3	Q16772	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	COPS8	Q99627	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548		E5RI56	91 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548		H3BQF6	201 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	WRB	O00258	174 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FPGT	O14772	594 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LRRTM2	O43300	516 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SUPT3H	O75486	399 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PRSS23	O95084	383 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	EML2	O95834	649 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC16A8	O95907	504 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	YES1	P07947	543 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	POU2F1	P14859	743 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PTGS2	P35354	604 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RUNX2	Q13950	521 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PLK5	Q496M5	336 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DPF1	Q92782	380 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GPR21	Q99679	349 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CLPB	Q9H078	707 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms