RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2W5A6NFC9 320 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DLL1O00548 723 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 GDF9O60383 454 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 RFPL3O75679 317 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP10O95393 424 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 HBQ1P09105 142 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MAOAP21397 527 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 KDELR2P33947 212 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK6Q00534 326 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MC2RQ01718 297 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SCARB2Q14108 478 aa23.3■■□□□ 1.32
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CAPNS1-215ENST00000628018 A4GALTQ9NPC4 353 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ANAPC2Q9UJX6 822 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PLOD3O60568 738 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA1P01009 418 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 KHKP50053 298 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 BIKQ13323 160 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 COX15Q7KZN9 410 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PACS2Q86VP3 889 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NFKBIDQ8NI38 313 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM110BQ8TC76 370 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf58Q96GQ5 468 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NECTIN3Q9NQS3 549 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO8Q9NRD0 319 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A11Q9NSA0 550 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 STOML1Q9UBI4 398 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 AURKCQ9UQB9 309 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP210LQ5VU65 1888 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 FER1L5A0AVI2 2057 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10H2O60403 315 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ONECUT2O95948 504 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TFPTP0C1Z6 253 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CT62P0C5K7 136 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SESN3P58005 492 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP4K2Q12851 820 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MYBPC3Q14896 1274 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 QSOX2Q6ZRP7 698 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PIP4P1Q86T03 277 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A8Q8IWU4 369 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 EID3Q8N140 333 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PQLC1Q8N2U9 271 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5D16Q8NGK9 328 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB8BQ92930 207 aa23.28■■□□□ 1.32
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CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A4EQ96PG1 132 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 EFHD1Q9BUP0 239 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf21Q9HAI6 301 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN8OSP0DMR3 200 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 OR12D1P0DN82 309 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL4P13236 92 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 GCKP35557 465 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 STT3AP46977 705 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN2A2P49641 1150 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SERTAD2Q14140 314 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC157Q569K6 752 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 VWA2Q5GFL6 755 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TBCELQ5QJ74 424 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC80Q76M96 950 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 LILRA2Q8N149 483 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM86B1Q8N7N1 296 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SIMC1Q8NDZ2 872 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO30Q8TB52 745 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC38A5Q8WUX1 472 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF31Q96EP0 1072 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CTRCQ99895 268 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 YIPF4Q9BSR8 244 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTRT3Q9BYD9 372 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TOR4AQ9NXH8 423 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNSP34059 522 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 RORAP35398 523 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK10P53779 464 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK11Q15759 364 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CDCP2Q5VXM1 449 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD12Q6NUT3 480 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ENPP6Q6UWR7 440 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 LGI4Q8N135 537 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DOK4Q8TEW6 326 aa23.27■■□□□ 1.32
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