RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		A8MU76	341 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MPTX1	A8MV57	137 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		A8MXK9	166 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		E9PQ18	207 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		G3V2L1	256 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCS	O14618	274 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF749	O43361	778 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SYT7	O43581	403 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZBTB14	O43829	449 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHRNG	P07510	517 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	P4HA1	P13674	534 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANPEP	P15144	967 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACKR3	P25106	362 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCR4	P51679	360 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NDST2	P52849	883 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	BACE1	P56817	501 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ERVK-16	P61578	105 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GABPA	Q06546	454 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	RBBP4	Q09028	425 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	AP1B1	Q10567	949 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPR50	Q13585	617 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ENPP2	Q13822	863 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ECSCR	Q19T08	205 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF613	Q6PF04	617 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LAX1	Q8IWV1	398 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPSTI1	Q96J88	318 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LGMN	Q99538	433 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACPT	Q9BZG2	426 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM245	Q9H330	911 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MARCH7	Q9H992	704 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	S100A14	Q9HCY8	104 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MED17	Q9NVC6	651 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	APPL1	Q9UKG1	709 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDZD2	O15018	2839 aa		2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRBA	P50851	2863 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NSD2	O96028	1365 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ITPR2	Q14571	2701 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A1B0GU03	582 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SERINC4	A6NH21	518 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANHX	E9PGG2	379 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDHX	O00330	501 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SOCS3	O14543	225 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATP6V1G1	O75348	118 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FGF19	O95750	216 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SFTPB	P07988	381 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SERPINF2	P08697	491 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NUDT17	P0C025	328 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ODC1	P11926	461 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF18	P17022	549 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP3A5	P20815	502 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ID1	P41134	155 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	VEGFC	P49767	419 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NT5C2	P49902	561 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	UCP2	P55851	309 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNK10	P57789	538 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GALK2	Q01415	458 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NFATC2	Q13469	925 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAPSN	Q13702	412 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GIT2	Q14161	759 aa		2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FCN2	Q15485	313 aa		2.54	□□□□□ -2

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