RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 PARVBQ9HBI1 364 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-217ENST00000580654 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-217ENST00000580654 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-217ENST00000580654 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-217ENST00000580654 WWOXQ9NZC7 414 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-217ENST00000580654 INTUQ9ULD6 942 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-217ENST00000580654 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-217ENST00000580654 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-217ENST00000580654 VWFP04275 2813 aa6.9□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TP53I11O14683 189 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FGF17O60258 216 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 LILRA1O75019 489 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PEX14O75381 377 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TJP3O95049 919 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 VENTXO95231 258 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PPP3CBP16298 524 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FDFT1P37268 417 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 STT3AP46977 705 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PLA2G16P53816 162 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CLDN15P56746 228 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC37A1P57057 533 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CSHL1Q14406 222 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.311e-6■■■■□ 25.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 DUPD1Q68J44 220 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM166AQ6J272 317 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FBXL20Q96IG2 436 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SERINC2Q96SA4 455 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 DNAJC7Q99615 494 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 NTMT1Q9BV86 223 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 KIFC1Q9BW19 673 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PELI2Q9HAT8 420 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SERHLQ9NQF3 203 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SYBUQ9NX95 663 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PP18 115 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC22A20A6NK97 555 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SMTNL1A8MU46 457 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 E7EVH7 732 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CLOCKO15516 846 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FTCDO95954 541 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 C8GP07360 202 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC25A16P16260 332 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PTNP21246 168 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 MGAT1P26572 445 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 NUDT6P53370 316 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 HERVK_113P63132 956 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ERVK-8P63133 956 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 GPS1Q13098 491 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SP140Q13342 867 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CYP1B1Q16678 543 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2A2Q6IF42 318 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 DTX2Q86UW9 622 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF525Q8N782 197 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 C3orf56Q8N813 242 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2L5Q8NG80 312 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 RDH11Q8TC12 318 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 HTRA1Q92743 480 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FBXL8Q96CD0 374 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 IQCDQ96DY2 449 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.88□□□□□ -1.31
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