RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCKDHAP12694 445 aa20.54■□□□□ 0.88
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NTSP30990 170 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MPIP34949 423 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MGAT2Q10469 447 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LTB4RQ15722 352 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGFBP7Q16270 282 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIGGQ5H8A4 983 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM111BQ6SJ93 734 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OPN5Q6U736 354 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC15A4Q8N697 577 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF615Q8N8J6 731 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRHL3Q8TE85 626 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERP27Q96DN0 273 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLHL1Q9NR64 748 aa20.54■□□□□ 0.88
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFL2Q9Y281 166 aa20.54■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO1GB0I1T2 1018 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NME2P1O60361 137 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBX19O60806 448 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR6B1O95007 311 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WISP1O95388 367 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NME2P22392 152 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTGER1P34995 402 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOX3P41225 446 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMU1Q2TAY7 513 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF628Q5EBL2 1059 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCORP1Q8N888 145 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HES7Q9BYE0 225 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 REEP4Q9H6H4 257 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.53■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLF11O14901 512 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VPS4BO75351 444 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SASH3O75995 380 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLITRK5O94991 958 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CBX7O95931 251 aa20.52■□□□□ 0.88
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX5P17844 614 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOX18P35713 384 aa20.52■□□□□ 0.88
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF441Q8N8Z8 693 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C17orf47Q8NEP4 570 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAR1Q8WVX9 515 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TP53INP1Q96A56 240 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPCDCQ96CD2 204 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTERF3Q96E29 417 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAAR6Q96RI8 345 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C1orf50Q9BV19 199 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VPS4AQ9UN37 437 aa20.52■□□□□ 0.88
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRATO95237 230 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCSK2P16519 638 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HPCAL1P37235 193 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.873e-12■□□□□ 11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OCRLQ01968 901 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRSS53Q2L4Q9 553 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL23RQ5VWK5 629 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL20RBQ6UXL0 311 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTL4Q6ZR62 310 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAGAPQ8N103 731 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LIX1Q8N485 282 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SGCZQ96LD1 299 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PNPOQ9NVS9 261 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASIC5Q9NY37 505 aa20.51■□□□□ 0.87
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRODH2Q9UF12 536 aa20.51■□□□□ 0.87
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