RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 PTGER4P35408 488 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 BTKQ06187 659 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 TMEM64Q6YI46 380 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 PAQR8Q8TEZ7 354 aa8.3□□□□□ -1.08
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LMO3-222ENST00000540445 SARAFQ96BY9 339 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 TMEM237Q96Q45 408 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 SMC6Q96SB8 1091 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 DOHHQ9BU89 302 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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LMO3-222ENST00000540445 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PPM1 405 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 CCDC151A5D8V7 595 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 SMIM23A6NLE4 172 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.29□□□□□ -1.08
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LMO3-222ENST00000540445 SUSD5O60279 629 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 TRAPPC6AO75865 159 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 CLPSP04118 112 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 CELA3AP09093 270 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 MYL2P10916 166 aa8.29□□□□□ -1.08
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LMO3-222ENST00000540445 CCT5P48643 541 aa8.29□□□□□ -1.08
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LMO3-222ENST00000540445 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 FUT7Q11130 342 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 FOXO1Q12778 655 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 TOMM20Q15388 145 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 NTRK2Q16620 822 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.29□□□□□ -1.08
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LMO3-222ENST00000540445 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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LMO3-222ENST00000540445 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 CFL2Q9Y281 166 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 TIMM22Q9Y584 194 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 A0A1B0GVC2 190 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-222ENST00000540445 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.28□□□□□ -1.08
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