RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537529.6

MKS1-204, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-204ENST00000537529 GSAPA4D1B5 854 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 URADA6NGE7 173 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CDK1P06493 297 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 MAGP20916 626 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CHMP24386 653 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 RABIFP47224 123 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 TNFRSF17Q02223 184 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FUT5Q11128 374 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 DGCR6Q14129 220 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 GPAT3Q53EU6 434 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 NUP43Q8NFH3 380 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OR10G6Q8NH81 332 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 GGHQ92820 318 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 BORCS5Q969J3 196 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ZNF681Q96N22 645 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SERINC2Q96SA4 455 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OR6C74A6NCV1 312 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FAM227AF5H4B4 570 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 M0R3H8 397 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ASNA1O43681 348 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OR10H3O60404 316 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SEMA7AO75326 666 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 TNFP01375 233 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OSMP13725 252 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 NR4A1P22736 598 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 MC3RP41968 323 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 TFF2Q03403 129 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 GPR18Q14330 331 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SEC23BQ15437 767 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 LACC1Q8IV20 430 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ELP4Q96EB1 424 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OR7D2Q96RA2 312 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 PINK1Q9BXM7 581 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CALML5Q9NZT1 146 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SH3D21A4FU49 640 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 LCKP06239 509 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 INHBBP09529 407 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CPN2P22792 545 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 POU1F1P28069 291 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 NUDT6P53370 316 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 STX19Q8N4C7 294 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 LINC00471Q8N535 108 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OR2A5Q96R48 311 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ITPAQ9BY32 194 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 POT1Q9NUX5 634 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CLN6Q9NWW5 311 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 LIPT1Q9Y234 373 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 LAMA3Q16787 3333 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 A0A0J9YVX5 310 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 A0A1W2PRQ8 180 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 A0A1W2PS29 197 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 B3GALT2O43825 422 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 LGI1O95970 557 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 GLULP15104 373 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CCINQ13939 588 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FCRL6Q6DN72 434 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 OR13H1Q8NG92 308 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 C10orf90Q96M02 699 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FUZQ9BT04 418 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 EQTNQ9NQ60 294 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-204ENST00000537529 C2orf74A8MZ97 194 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms