RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 SMIM6P0DI80 62 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ITIH1P19827 911 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NR2F2P24468 414 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 G0S2P27469 103 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TACR3P29371 465 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CRABP1P29762 137 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ECHS1P30084 290 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SLC1A3P43003 542 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CRATP43155 626 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 OR3A3P47888 321 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CSNK1DP48730 415 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ERFP50548 548 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 BCAT1P54687 386 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 UCNP55089 124 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 XIAPP98170 497 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ILKQ13418 452 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ALCAMQ13740 583 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FGL2Q14314 439 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ITIH4Q14624 930 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PDSS1Q5T2R2 415 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DDI2Q5TDH0 399 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MSANTD2Q6P1R3 559 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 IQCHQ86VS3 1027 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CMIPQ8IY22 773 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MTERF3Q96E29 417 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SNX18Q96RF0 628 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZBTB18Q99592 522 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SMOQ99835 787 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MED10Q9BTT4 135 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SIAEQ9HAT2 523 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CENPMQ9NSP4 180 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DECR2Q9NUI1 292 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RELNP78509 3460 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 INSIG1O15503 277 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SLC28A2O43868 658 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DIRAS3O95661 229 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KLKB1P03952 638 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 WNT1P04628 370 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FCER2P06734 321 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SBK2P0C263 348 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ITGAMP11215 1152 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CDKN2CP42773 168 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ARSEP51690 589 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PPP5CP53041 499 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 METAP1P53582 386 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 C21orf59P57076 290 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TIGD6Q17RP2 521 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KLHL26Q53HC5 615 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ESCO2Q56NI9 601 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 COLEC12Q5KU26 742 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MANEAQ5SRI9 462 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DDIASQ8IXT1 998 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 EID2Q8N6I1 236 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FIBINQ8TAL6 211 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MITD1Q8WV92 249 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FAM162AQ96A26 154 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms