RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636		Q6ZRM9	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MED25	Q71SY5	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PBK	Q96KB5	322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	NEU1	Q99519	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CCT7	Q99832	543 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	VCX2	Q9H322	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	WRB	O00258	174 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CLIC2	O15247	247 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OGT	O15294	1046 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	INPP4B	O15327	924 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CLN5	O75503	358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	JRK	O75564	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CH25H	O95992	272 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OPN1LW	P04000	364 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CTSL	P07711	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ANPEP	P15144	967 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	AREG	P15514	252 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FUT1	P19526	365 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SOAT1	P35610	550 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	LHX1	P48742	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB28	P51157	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CHN2	P52757	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	UCP2	P55851	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TIRAP	P58753	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ARPC4	P59998	168 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SST	P61278	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	NHLH2	Q02577	135 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TFF3	Q07654	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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