RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 GABRR3A8MPY1 467 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ITGAMP11215 1152 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PRPS1L1P21108 318 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MPIP34949 423 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ARFIP2P53365 341 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CLDN8P56748 225 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 STX1BP61266 288 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CPTPQ5TA50 214 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 OGFOD2Q6N063 350 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 AMER2Q8N7J2 671 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 FAR1Q8WVX9 515 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 KCNK13Q9HB14 408 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ASIC5Q9NY37 505 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.79□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 A8MUI8 341 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PDPK1O15530 556 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CELA2AP08217 269 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 EDN3P14138 238 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 IDO1P14902 403 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 LSP1P33241 339 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PTGER1P34995 402 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SEC24CP53992 1094 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SLC26A5P58743 744 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PRR7Q8TB68 274 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 GRHL3Q8TE85 626 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MTERF3Q96E29 417 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ART5Q96L15 291 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ZBTB18Q99592 522 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MMP25Q9NPA2 562 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 AIG1Q9NVV5 245 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 STMN3Q9NZ72 180 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.78□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 GMNCA6NCL1 334 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 OR5H15A6NDH6 313 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 UFM1P61960 85 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 GSTA3Q16772 222 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 BCORP1Q8N888 145 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 MORN4Q8NDC4 146 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NUDT8Q8WV74 236 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 NCLNQ969V3 563 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ABI3Q9P2A4 366 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.77□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 CFLARO15519 480 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 SEMA7AO75326 666 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 WDPCPO95876 746 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 GPC1P35052 558 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 CLCN2P51788 898 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 TERF2Q15554 542 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 LTB4RQ15722 352 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 ZNF385BQ569K4 471 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 LGI4Q8N135 537 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 MIER2Q8N344 545 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 KAT2AQ92830 837 aa14.76□□□□□ -0.05
MEG3-217ENST00000521404 VMP1Q96GC9 406 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms