RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 LOC100653049A0A140TA62 436 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 BBIP1A8MTZ0 92 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 B8ZZF3 427 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SOCS6O14544 535 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 KRT34O76011 436 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SLITRK5O94991 958 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 FAM87AP0C7U9 286 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 COX4I1P13073 169 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PGDP52209 483 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TERF2Q15554 542 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SPRED3Q2MJR0 410 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SLC2A7Q6PXP3 512 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 MRGPREQ86SM8 312 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TREML1Q86YW5 311 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 CLECL1Q8IZS7 167 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ART5Q96L15 291 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC115Q96NT0 180 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PANX1Q96RD7 426 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF700Q9H0M5 742 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TAS2R9Q9NYW1 312 aa18.74■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 CDC14CA4D256 554 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SAGE2PA6NJ88 616 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 CAPN14A8MX76 684 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 RFXANKO14593 260 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ANP32DO95626 131 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 CD1EP15812 388 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PRDX6P30041 224 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PTGER1P34995 402 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SOAT1P35610 550 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 KIRREL2Q6UWL6 708 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM107Q6UX40 140 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 VWA5B2Q8N398 1253 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 OR11G2Q8NGC1 345 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF675Q8TD23 568 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 KAT2AQ92830 837 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 CNPPD1Q9BV87 410 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 CXorf21Q9HAI6 301 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 MAT2BQ9NZL9 334 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SNX8Q9Y5X2 465 aa18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SCN2BO60939 215 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 COX6A1P12074 109 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 CDK9P50750 372 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 HBA1P69905 142 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 MAP4K2Q12851 820 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 NFATC3Q12968 1075 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PCOLCEQ15113 449 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TLR1Q15399 786 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SPDYE7PQ495Y7 208 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF628Q5EBL2 1059 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 NDUFAF7Q7L592 441 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 MORN4Q8NDC4 146 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 DOK4Q8TEW6 326 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 FBXL20Q96IG2 436 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 MESP1Q9BRJ9 268 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 C3orf14Q9HBI5 128 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 P4HTMQ9NXG6 502 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 COPS7AQ9UBW8 275 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 VPS4AQ9UN37 437 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ERVK-19Q9WJR5 959 aa18.72■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 A0A1W2PQ72 361 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ASPDHA6ND91 283 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 J3QKU1 62 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 KCNH1O95259 989 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PRKAR1AP10644 381 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 MC3RP41968 323 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 TRPC1P48995 793 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 KRT72Q14CN4 511 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 COQ5Q5HYK3 327 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 REP15Q6BDI9 236 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 FAM111BQ6SJ93 734 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 SZRD1Q7Z422 152 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 GTF2H4Q92759 462 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 ELP4Q96EB1 424 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 MAGED4Q96JG8 741 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 INPP5KQ9BT40 448 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 OR8D2Q9GZM6 311 aa18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SMIM20-201ENST00000506197 PTGFRNQ9P2B2 879 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms