RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	AMER2	Q8N7J2	671 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2M7	Q8NG81	312 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	DIO2	Q92813	273 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	APIP	Q96GX9	242 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNA7	Q96RP8	456 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	DOHH	Q9BU89	302 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	EBPL	Q9BY08	206 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf109	Q9NX04	203 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF225	Q9UK10	706 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	EMCN	Q9ULC0	261 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TENM4	Q6N022	2769 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246		A1L4Q6	167 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	HS6ST1	O60243	411 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX4	O95219	450 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NAGA	P17050	411 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	DDC	P20711	480 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SSTR4	P31391	388 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ASMT	P46597	345 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	10.47	□□□□□ -0.73	3e-11	■■■■■ 40.2
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MDGA2	Q7Z553	956 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SARAF	Q96BY9	339 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF597	Q96LX8	424 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GTL3	188 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	OR14I1	A6ND48	311 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM166B	A8MTA8	275 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	BCKDK	O14874	412 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TM9SF1	O15321	606 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCB7	O75027	752 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA4L	O95757	839 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	IL12B	P29460	328 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDH3A1	P30838	453 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	GPC1	P35052	558 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	RFC3	P40938	356 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MAN2A2	P49641	1150 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	HTR6	P50406	440 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73	2e-13	■■■□□ 18.4
TTLL3-231	ENST00000496246	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PCLAF	Q15004	111 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	TOMM20	Q15388	145 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NTRK2	Q16620	822 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-231	ENST00000496246	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		10.46	□□□□□ -0.73

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