RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495893.6

PHC3-215, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHC3, Length 12,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-215ENST00000495893 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
PHC3-215ENST00000495893 NEUROD4Q9HD90 331 aa3.65□□□□□ -1.82
PHC3-215ENST00000495893 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.65□□□□□ -1.82
PHC3-215ENST00000495893 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
PHC3-215ENST00000495893 A0A1W2PP18 115 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ACOD1A6NK06 481 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 FAM166BA8MTA8 275 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 GPR89AB7ZAQ6 455 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 DEDDO75618 318 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ALPIP09923 528 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 GPR89BP0CG08 455 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PRPS1L1P21108 318 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 CLCQ05315 142 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SCAPQ12770 1279 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 CNIH2Q6PI25 160 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 OTOP1Q7RTM1 612 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ZNF606Q8WXB4 792 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 RNF157Q96PX1 679 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 OMDQ99983 421 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 GBA3Q9H227 469 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ACP6Q9NPH0 428 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ARGFXA6NJG6 315 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 D6RAR5 112 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PPP5D1E7EU14 171 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 TXNDC12O95881 172 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ZP3P21754 424 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 GRB10Q13322 594 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PMS2P3Q13401 168 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 FCN2Q15485 313 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 EPGNQ6UW88 154 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 C5orf34Q96MH7 638 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 OR6C2Q9NZP2 312 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 A0A0U1RQK1 487 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 MROH6A6NGR9 719 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 STK16O75716 305 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 STAG3L3P0CL85 134 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PTH2RP49190 550 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PLA2G7Q13093 441 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SPHARQ15513 63 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SCIMPQ6UWF3 145 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SYT14Q8NB59 555 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ARSGQ96EG1 525 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 M0R2Z0 102 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 TMEM63AO94886 807 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 CNR1P21554 472 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.835e-12■■■■■ 60.8
PHC3-215ENST00000495893 CA5AP35218 305 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 RAB28P51157 221 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 MTPNP58546 118 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ADIGQ0VDE8 80 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SPCS2Q15005 226 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 DUSP28Q4G0W2 176 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 RTL6Q6ICC9 239 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 KIAA1211LQ6NV74 962 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 Q6ZNX1 250 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ACOT1Q86TX2 421 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 LINC01599Q8WXQ3 324 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 COPS8Q99627 209 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 EPYCQ99645 322 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 LMAN1LQ9HAT1 526 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 PDE7BQ9NP56 450 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 FNIP2Q9P278 1114 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 DUXAA6NLW8 204 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 FMO6PO60774 539 aa3.65□□□□□ -1.83
PHC3-215ENST00000495893 GAAP10253 952 aa3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms