RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 DNASE1P24855 282 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MTNR1AP48039 350 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NRIP1P48552 1158 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SREBF2Q12772 1141 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NTRK2Q16620 822 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 GXYLT1Q4G148 440 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 C4orf46Q504U0 113 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 LMAN2LQ9H0V9 348 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NCOR1O75376 2440 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 OR6C74A6NCV1 312 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 GPX5O75715 221 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PTTG1O95997 202 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 HNMTP50135 292 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MINDY4Q4G0A6 757 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MSRB3Q8IXL7 192 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TEX19Q8NA77 164 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 GPR150Q8NGU9 434 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PLD4Q96BZ4 506 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CRELD1Q96HD1 420 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 QRFPRQ96P65 431 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A18Q9H1K4 315 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MARK1Q9P0L2 795 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ENPP4Q9Y6X5 453 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SDK2Q58EX2 2172 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 LYRM1O43325 122 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PI15O43692 258 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 JRKO75564 520 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 GRK5P34947 590 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 VIPR2P41587 438 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SPINT3P49223 89 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TLE2Q04725 743 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 C3orf14Q9HBI5 128 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 FKBP7Q9Y680 259 aa11.75□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 KMOO15229 486 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NTN1O95631 604 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CRYZL1O95825 349 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TSPAN12O95859 305 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SRCP12931 536 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PSMB10P40306 273 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ARL4DP49703 201 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 HTRA3P83110 453 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SPIN4Q56A73 249 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 XKR7Q5GH72 579 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 HES5Q5TA89 166 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 NLRP8Q86W28 1048 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 KLHL36Q8N4N3 616 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 HORMAD2Q8N7B1 307 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 COX18Q8N8Q8 333 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 OR8J1Q8NGP2 316 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CEP76Q8TAP6 659 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF559Q9BR84 538 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 TAS2R7Q9NYW3 318 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 ROS1P08922 2347 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 UBE2QL1A1L167 161 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 EOMESO95936 686 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 HLA-DPB1P04440 258 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 CBLBQ13191 982 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 BEX5Q5H9J7 111 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 OOSP2Q86WS3 158 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 FTMTQ8N4E7 242 aa11.74□□□□□ -0.53
TRIOBP-211ENST00000492485 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.74□□□□□ -0.53
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