RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482019.1

LINC02004-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2004, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC02004, Length 294 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC02004-201ENST00000482019 CNIH4Q9P003 139 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ZNF639Q9UID6 485 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 NBASA2RRP1 2371 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 A0A0G2JMM0 328 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 A0A1W2PPB8 328 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 A0A1W2PRS3 328 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 A1L4Q6 167 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PINLYPA6NC86 204 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CCL21O00585 134 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 AZIN1O14977 448 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 RGS14O43566 566 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ZG16O60844 167 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 SPAG7O75391 227 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CCL3P10147 92 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 NEFHP12036 1026 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 DDCP20711 480 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 S1PR1P21453 382 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 GPX3P22352 226 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PTGER1P34995 402 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 SERPINB5P36952 375 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ZNF844Q08AG5 666 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 MGAT2Q10469 447 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CEBPEQ15744 281 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 NTRK2Q16620 822 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 KRT71Q3SY84 523 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 TBCELQ5QJ74 424 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 KANK2Q63ZY3 851 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PAOXQ6QHF9 649 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 RPTNQ6XPR3 784 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 EID3Q8N140 333 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 FAM13CQ8NE31 585 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 OR10G3Q8NGC4 313 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ZNF675Q8TD23 568 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 MYNNQ9NPC7 610 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PRODH2Q9UF12 536 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ESPL1Q14674 2120 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 G3V3Y1 287 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PRRG2O14669 202 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 TP53I11O14683 189 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ACOX3O15254 700 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 TYROBPO43914 113 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 SEC22BO75396 215 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 SLITRK5O94991 958 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CLDN1O95832 211 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CBX7O95931 251 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 FGF4P08620 206 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 NAGAP17050 411 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 MPIP34949 423 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 PTGS2P35354 604 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 DNASE1L1P49184 302 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 DCAF7P61962 342 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 KCNJ2P63252 427 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 HSF1Q00613 529 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 DUSP2Q05923 314 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 C2orf80Q0P641 193 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 FOXO1Q12778 655 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 RPS6KA2Q15349 733 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 LTB4RQ15722 352 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 C3AR1Q16581 482 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC02004-201ENST00000482019 CROCCP2Q86T23 111 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms