RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 TNFRSF4P43489 277 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SLC12A3P55017 1021 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 GSG1Q2KHT4 349 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SMU1Q2TAY7 513 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 OLFML2AQ68BL7 652 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 GPR142Q7Z601 462 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD23Q86SG2 305 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SLC34A3Q8N130 599 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 DCTPP1Q9H773 170 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.9□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 UGT1A6P19224 532 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 FNTAP49354 379 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 LUZP1Q86V48 1076 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SERPINA12Q8IW75 414 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 PTP4A1Q93096 173 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 PRAM1Q96QH2 718 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 TIGARQ9NQ88 270 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.89□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PRV1 198 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 EFCAB7A8K855 629 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SLC28A1O00337 649 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 FMO6PO60774 539 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 IGHV3-9P01782 118 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 PGAM2P15259 253 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB25P24278 435 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ACADSBP45954 432 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A1P53007 311 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 UCP2P55851 309 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 CDKL1Q00532 357 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 IYDQ6PHW0 289 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 GCNT7Q6ZNI0 430 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 RDH11Q8TC12 318 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ST7LQ8TDW4 575 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 CLEC4EQ9ULY5 219 aa4.88□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 A0A0A6YYD4 124 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 PRAMEF12O95522 483 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 NUDT14O95848 222 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SFTPBP07988 381 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SLC35E2P0CK97 266 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 FERP16591 822 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ZNF131P52739 623 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 NDST1P52848 882 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 RAPH1Q70E73 1250 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ASRGL1Q7L266 308 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 Q8N7P7 452 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 NRN1Q9NPD7 142 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 EMCNQ9ULC0 261 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.87□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 LAMP1P11279 417 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 MEOX2P50222 304 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1024LP59773 190 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ZNF79Q15937 498 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 HAGHQ16775 308 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 MICAQ29983 383 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 HKDC1Q2TB90 917 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 GPAT3Q53EU6 434 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 TAF3Q5VWG9 929 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 B3GLCTQ6Y288 498 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SFRP1Q8N474 314 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ZNF525Q8N782 197 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 RAB39BQ96DA2 213 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 C5orf30Q96GV9 206 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 GPR174Q9BXC1 333 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 RAI14Q9P0K7 980 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 NARFQ9UHQ1 456 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.86□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 ATP6V1G1O75348 118 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 IDSP22304 550 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 PDE7AQ13946 482 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 IQCA1Q86XH1 822 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 PAXXQ9BUH6 204 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 IKZF5Q9H5V7 419 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 IL17CQ9P0M4 197 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.85□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 CYB561D2O14569 222 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 VCPP55072 806 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 B3GALT6Q96L58 329 aa4.84□□□□□ -1.63
SGCE-210ENST00000472326 GPR137Q96N19 417 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms