RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 P04436 131 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 STSP08842 583 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MYZAPP0CAP1 466 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DDCP20711 480 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ARRB2P32121 409 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MPIP34949 423 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RFC3P40938 356 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SERPINB4P48594 390 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RBPJQ06330 500 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 LTB4RQ15722 352 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CEBPEQ15744 281 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C4orf17Q53FE4 359 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SLC22A10Q63ZE4 541 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SIAH3Q8IW03 269 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DDIASQ8IXT1 998 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TAGAPQ8N103 731 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 OR2M7Q8NG81 312 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 AGR3Q8TD06 166 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 EGLN2Q96KS0 407 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MYNNQ9NPC7 610 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C1orf109Q9NX04 203 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 EHD3Q9NZN3 535 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RELNP78509 3460 aa8.45□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 A0A1B0GUH1 482 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 WIPF3A6NGB9 483 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 G3V3Y1 287 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PIP5K1BO14986 540 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 BIRC5O15392 142 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 LRRTM2O43300 516 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ITM2AO43736 263 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 HS6ST1O60243 411 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZWINTO95229 277 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CBX7O95931 251 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FBXO45P0C2W1 286 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 RNF224P0DH78 156 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CCL3P10147 92 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 NEFHP12036 1026 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PCSK2P16519 638 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF24P17028 368 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GPX3P22352 226 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TACR1P25103 407 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PIGAP37287 484 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DUSP8Q13202 625 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MPP2Q14168 576 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CHI3L2Q15782 390 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 NTRK2Q16620 822 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CES4AQ5XG92 561 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TMEM64Q6YI46 380 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PAQR8Q8TEZ7 354 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 KAT2AQ92830 837 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FCRL1Q96LA6 429 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 BBS4Q96RK4 519 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 CFL2Q9Y281 166 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.44□□□□□ -1.06
SYN3-211ENST00000472027 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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