RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472004.5

GYS1-204, Transcript of glycogen synthase 1, human

TSL 3

Gene GYS1, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYS1-204	ENST00000472004	MED25	Q71SY5	747 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF675	Q8TD23	568 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SPSB2	Q99619	263 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004		A0A087WV62	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PEX12	O00623	359 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	GSC2	O15499	205 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PRAMEF2	O60811	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	DNAJA2	O60884	412 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PDE5A	O76074	875 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	RECK	O95980	971 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	LIPC	P11150	499 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	MATN1	P21941	496 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SLC6A2	P23975	617 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CPOX	P36551	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CASP9	P55211	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	FOXL2	P58012	376 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	LIPE	Q05469	1076 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	RTP5	Q14D33	572 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	RNF130	Q86XS8	419 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	ZFP90	Q8TF47	636 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PRODH2	Q9UF12	536 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CFL2	Q9Y281	166 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004		H0YHG0	523 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	FXYD1	O00168	92 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	UPK1A	O00322	258 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PLOD2	O00469	737 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SPINK2	P20155	84 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	ME2	P23368	584 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SOX11	P35716	441 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	HPCA	P84074	193 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	FADD	Q13158	208 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SSPN	Q14714	243 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SAXO2	Q658L1	398 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	MORN4	Q8NDC4	146 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	OR10A6	Q8NH74	314 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	FBXO30	Q8TB52	745 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	NKD1	Q969G9	470 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GYS1-204	ENST00000472004	NCLN	Q969V3	563 aa		13.4	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms