RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 S1PR1P21453 382 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CA7P43166 264 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 GSTM5P46439 218 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP2Q05923 314 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MAP4K2Q12851 820 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SLC22A10Q63ZE4 541 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 GK5Q6ZS86 529 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SPPL2CQ8IUH8 684 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF441Q8N8Z8 693 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FAM13CQ8NE31 585 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TP53INP1Q96A56 240 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF681Q96N22 645 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MECRQ9BV79 373 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.12■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ACOT7O00154 380 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZG16O60844 167 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TUBBP07437 444 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO45P0C2W1 286 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ABOP16442 354 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PPIAP62937 165 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF844Q08AG5 666 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MGAT2Q10469 447 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 LTB4RQ15722 352 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 C3AR1Q16581 482 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SENP1Q9P0U3 644 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF835Q9Y2P0 537 aa22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FAM166BA8MTA8 275 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SLC28A1O00337 649 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNHIT1O43257 154 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 NPHS1O60500 1241 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CHEK2O96017 543 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 DNASE1L1P49184 302 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 C2orf80Q0P641 193 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CMPK2Q5EBM0 449 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM64Q6YI46 380 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ADIPOR1Q96A54 375 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TTTY12Q9BZ98 90 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TINAGQ9UJW2 476 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CFL2Q9Y281 166 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 GTF3C1Q12789 2109 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 EML6Q6ZMW3 1958 aa22.1■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CAPN14A8MX76 684 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 RGS14O43566 566 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SEC22BO75396 215 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CHRNGP07510 517 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 GPX3P22352 226 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PIGAP37287 484 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 NRG3P56975 720 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 NOXRED1Q6NXP6 359 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SLC22A16Q86VW1 577 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 OR10G3Q8NGC4 313 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 OR5M3Q8NGP4 307 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PAQR8Q8TEZ7 354 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB127Q9H1M4 99 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SH2D2AQ9NP31 389 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 EHD3Q9NZN3 535 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF639Q9UID6 485 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CCL27Q9Y4X3 112 aa22.09■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GTH9 108 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TYROBPO43914 113 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PDE9AO76083 593 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 CLDN1O95832 211 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PCSK2P16519 638 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 DDCP20711 480 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 NTRK2Q16620 822 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 PRAMEF20Q5VT98 475 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 KANK2Q63ZY3 851 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 MTFR2Q6P444 385 aa22.08■■□□□ 1.13
SMKR1-201ENST00000462322 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms