RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433271.6

TMEM248-205, Transcript of transmembrane protein 248, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM248, Length 1,610 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248-205ENST00000433271 GPX2P18283 190 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 TCN2P20062 427 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 KCNJ2P63252 427 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 VAC14Q08AM6 782 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CAMK2BQ13554 666 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 SPATS1Q496A3 300 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PIGGQ5H8A4 983 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 C6orf120Q7Z4R8 191 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 TMEM151BQ8IW70 566 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 OR56A1Q8NGH5 318 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 METTL21AQ8WXB1 218 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 MAGED4Q96JG8 741 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ECSITQ9BQ95 431 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ADAP2Q9NPF8 381 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ASCL3Q9NQ33 180 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 DXOO77932 396 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 TNNI3P19429 210 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 FHL5Q5TD97 284 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 C6orf163Q5TEZ5 329 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 GPR155Q7Z3F1 870 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 VWA5B2Q8N398 1253 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 OR2Y1Q8NGV0 311 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CT55Q8WUE5 264 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CLPTM1LQ96KA5 538 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CD300AQ9UGN4 299 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CCDC88CQ9P219 2028 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CFAP73A6NFT4 308 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CT62P0C5K7 136 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 TP53BP2Q13625 1128 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CEACAM7Q14002 265 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 RTP5Q14D33 572 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PGM2L1Q6PCE3 622 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 SZRD1Q7Z422 152 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ULK2Q8IYT8 1036 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 FBXW8Q8N3Y1 598 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 OR52N2Q8NGI0 321 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 FAM117AQ9C073 453 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 RAD21L1Q9H4I0 556 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 GPATCH2Q9NW75 528 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF639Q9UID6 485 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PRORSD1PA6NEY8 169 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 C17orf105B2RV13 164 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 DYRK3O43781 588 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 RAD1O60671 282 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 DNAJA2O60884 412 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 MVDP53602 400 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PRKAG1P54619 331 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 LIPEQ05469 1076 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 RGNQ15493 299 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 LANCL3Q6ZV70 420 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 RNF130Q86XS8 419 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 RNF148Q8N7C7 305 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 NUP43Q8NFH3 380 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 DOK4Q8TEW6 326 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 ANKRA2Q9H9E1 313 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 PACSIN3Q9UKS6 424 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM248-205ENST00000433271 C21orf140B9A014 251 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 NQO1P15559 274 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 S1PR1P21453 382 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 STAT5AP42229 794 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 FAAH2Q6GMR7 532 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 TMEM205Q6UW68 189 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 SERPINA11Q86U17 422 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 OR10A6Q8NH74 314 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 GPR87Q9BY21 358 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 ALG2Q9H553 416 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 PDE5AO76074 875 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 UMODP07911 640 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 HSD17B1P14061 328 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 MAGEA8P43361 318 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 OR4D2P58180 307 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 RPS15P62841 145 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 FUT7Q11130 342 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 FADDQ13158 208 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
TMEM248-205ENST00000433271 HPS6Q86YV9 775 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms