RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.1■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VPS4BO75351 444 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RASAL1O95294 804 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLPSP04118 112 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SP1P08047 785 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NTSP30990 170 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPIP34949 423 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASMTP46597 345 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DUSP2Q05923 314 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP4K2Q12851 820 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LTB4RQ15722 352 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEBPEQ15744 281 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGFBP7Q16270 282 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OPN5Q6U736 354 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC116Q8IYX3 515 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM9CQ8IZT9 166 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCORP1Q8N888 145 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADCY4Q8NFM4 1077 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCMH1Q96GD3 660 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EGLN2Q96KS0 407 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIMAP2Q9UG22 337 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VPS4AQ9UN37 437 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFL2Q9Y281 166 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa16.08■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNNO75324 88 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JUNP05412 331 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCKDHAP12694 445 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTGER1P34995 402 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOX3P41225 446 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF615Q8N8J6 731 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR9A2Q8NGT5 310 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF675Q8TD23 568 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRHL3Q8TE85 626 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTHRC1Q96CG8 243 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERP27Q96DN0 273 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf50Q9BV19 199 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HES7Q9BYE0 225 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 REEP4Q9H6H4 257 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCAP29Q9UHQ4 241 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKAP10O43572 662 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NME2P1O60361 137 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SASH3O75995 380 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLITRK5O94991 958 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR6B1O95007 311 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRATO95237 230 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRYABP02511 175 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRPS2P11908 318 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCSK2P16519 638 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NME2P22392 152 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HPCAL1P37235 193 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MGAT2Q10469 447 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIGGQ5H8A4 983 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIX1Q8N485 282 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC15A4Q8N697 577 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR52R1Q8NGF1 315 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C16orf52Q8NHV5 167 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPCDCQ96CD2 204 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OLAHQ9NV23 265 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNPOQ9NVS9 261 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRODH2Q9UF12 536 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF639Q9UID6 485 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLF11O14901 512 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDPK1O15530 556 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBX19O60806 448 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CBX7O95931 251 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 S1PR1P21453 382 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms