RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TLE1Q04724 770 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 EBPQ15125 230 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF385BQ569K4 471 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF628Q5EBL2 1059 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM156Q8N614 296 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR7G1Q8NGA0 311 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 NUBPLQ8TB37 319 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PPCDCQ96CD2 204 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 RASL10BQ96S79 203 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SH3BP4Q9P0V3 963 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 LRFN1Q9P244 771 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF639Q9UID6 485 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR6C76A6NM76 312 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SDHDO14521 159 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 NEURL1O76050 574 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 G6PDP11413 515 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 NTSP30990 170 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 CYB561P49447 251 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 HLCSP50747 726 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 DUSP8Q13202 625 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MDS2Q8NDY4 140 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 NUDT8Q8WV74 236 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 HES7Q9BYE0 225 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM4Q9C037 500 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PRAMEF2O60811 474 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 VPS4BO75351 444 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 CBX7O95931 251 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 DIO3P55073 304 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PDE7AQ13946 482 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 MPEG1Q2M385 716 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 SMU1Q2TAY7 513 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF227Q86WZ6 799 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 OR52R1Q8NGF1 315 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF675Q8TD23 568 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 C7orf26Q96N11 449 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 ASIC5Q9NY37 505 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3-202ENST00000410062 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 TBX19O60806 448 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 LBPP18428 481 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 EPHA3P29320 983 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 HPCAL1P37235 193 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 SOX3P41225 446 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF766Q5HY98 468 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 MAVSQ7Z434 540 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 CKAP2Q8WWK9 683 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 ASB15Q8WXK1 588 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 KLHL1Q9NR64 748 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 DTX4Q9Y2E6 619 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 PDPK1O15530 556 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 OR6B1O95007 311 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 PIGGQ5H8A4 983 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 OR7G2Q8NG99 324 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 CPT1CQ8TCG5 803 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 MTERF3Q96E29 417 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 MAP10Q9P2G4 905 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6V1HQ9UI12 483 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 CDK2AP1O14519 115 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM107Q6UX40 140 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 MAGEB18Q96M61 343 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 A8MVJ9 347 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3-202ENST00000410062 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.05■■□□□ 1.12
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