RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ACPTQ9BZG2 426 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CIPCQ9C0C6 399 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GLTPQ9NZD2 209 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MSRAQ9UJ68 235 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FZD4Q9ULV1 537 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC12A8A0AV02 714 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LEUTXA8MZ59 168 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 H3BNC9 293 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC16A5O15375 505 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KDELR3O43731 214 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SSX4O60224 188 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC19A2O60779 497 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR7A10O76100 309 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DIRAS1O95057 198 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DHFRP00374 187 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PDYNP01213 254 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV3-27P01718 113 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C8AP07357 584 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 POU2F2P09086 479 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NR2F6P10588 404 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RHCEP18577 417 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HMGCLP35914 325 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CRISP1P54107 249 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PNLIPRP1P54315 467 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CDH4P55283 916 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ERVFC1P60507 584 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SP140Q13342 867 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KCNC3Q14003 757 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IHHQ14623 411 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRCAPQ14761 206 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SHHQ15465 462 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SSX1Q16384 188 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFA9Q16795 377 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP6Q16828 381 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C4orf46Q504U0 113 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL22Q53GT1 634 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LIPJQ5W064 366 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MACC1Q6ZN28 852 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TAGAPQ8N103 731 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OXR1Q8N573 874 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM163Q8TC26 289 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2FQ969M7 185 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 COQ8BQ96D53 544 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 REPS1Q96D71 796 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CHFRQ96EP1 664 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TSSK3Q96PN8 268 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ15Q99712 375 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MMP28Q9H239 520 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HHATLQ9HCP6 504 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TIGARQ9NQ88 270 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HSPB11Q9Y547 144 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GVM2 712 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 BTN3A3O00478 584 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AP3D1O14617 1153 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LYRM1O43325 122 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OIP5O43482 229 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR1I1O60431 355 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TPST2O60704 377 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN11O75508 207 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LEFTY1O75610 366 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GADD45GO95257 159 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LATS1O95835 1130 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GUCA1CO95843 209 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CA3P07451 260 aa6.82□□□□□ -1.32
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